Los siguientes son los órganos de gobierno y dirección académica y administrativa de la Institución Universitaria Colombo Americana:

Una sala general, integrada por los fundadores y benefactores como máximo órgano de gobierno de la Institución, un Consejo Superior Universitario y un Consejo Académico.

SALA GENERAL

Es el máximo órgano de gobierno de la institución encargado de trazar sus políticas generales, definir su filosofía y ejecutar las demás atribuciones establecidas en los Estatutos.

CONSEJO SUPERIOR UNIVERSITARIO

Es el máximo organismo de dirección y administración de la Institución Universitaria Colombo Americana. Estará integrado por 9 miembros con sus respectivos suplentes personales, de los cuales 5 serán nombrados por la Sala General, uno será el Rector y 3 serán elegidos democráticamente así: Un (1) representante de los profesores, elegido de entre el personal docente en ejercicio, un (1) representante de los estudiantes, elegidos por los propios estudiantes del programa universitario y un (1) representante de los egresados, elegido de entre quienes conforman la Asociación de ex alumnos. En el lapso comprendido entre la iniciación de labores de UNICA y la graduación de la primera promoción, el lugar de representante de los egresados en el Consejo Superior Universitario será ejercido por un estudiante del semestre más avanzado, elegido también democráticamente por los estudiantes activos.